للجامعة قسم داخلي تؤوى فيه الطلاب الوافدين من خارج المدينة، وتوفر لهم التغذية والسكن والكتب الدراسية والعلاج دون مقابل ، وتقوم من خلال عمادة شئون الطلاب بتربيتهم وتوجيههم في مجال الدراسة والسلوك العام ، حتى يلتزموا بالأخلاق والآداب الفاضلة التي نص عليها الكتاب والسنة وأرشد إليها أئمة الدين ، وتقدم الجامعة لهم في حدود إمكانياتها جميع التسهيلات اللازمة لتنمية قدراتهم العلمية والثقافية ، وهم يقومون تحت إشراف من الأساتذة والمدرسين بممارسة عديد من النشاطات العلمية والثقافية والرياضية . والمدرسون الذين يسكنون داخل حرم الجامعة يراقبون الطلاب من ناحية المحافظة على الصلاة والتمسك بالقيم الخلقية والآداب الإسلامية.