يوجد في الجامعة قسم إدراة البحوث الإسلامية ، وقد تم إنشاؤه تلبية لحاجة العصر إلى الأدب الصالح الهادف والمؤلفات النافعة التي تساعد الأمة في التمسك بالدين والقيم الخلقية ، وترشد الشباب إلى معرفة مسئولياتهم وأداء واجباتهم نحو الأمة الإسلامية والمجتمع الإنساني، وتزودهم بثقافة واسعة ووعي قوي، حتى يقوموا بدورهم المنشود في العصر الحاضر.
وبإشراف من هذا القسم يقوم مدرسو الجامعة والعلماء الآخرون بتأليف الكتب وترجمتها وتحقيقها حسب الحاجة، وهو الذي يتولى إصدار مجلة (صوت الأمة) باللغة العربية شهريا، ومجلة (محدث) باللغة الأردية شهريا كذلك. وهما تصدران بصفة مستمرة وتعالج كل واحدة منهما القضايا الدينية والخلقية والاجتماعية.
والجدير بالذكر أن هذا القسم قد تمكن بعون الله وتوفيقه من إخراج ونشر نحو (421) كتاب ما بين مؤلف ومحقق ومترجم باللغات العربية والأردية والهندية والإنجليزية وبعض اللغات المحلية، ولا يزال مستمرا في نشاطاته وجهوده مع العلم بأن بعض هذه المنشورات تقع في أكثر من مجلد إلى 9 مجلدات .
وتملك الجامعة مطبعة آفسيت، وسبق أن اشتغلت فيها مطبعة بالحروف، والمطبعة الحديثة قد نقلت بنشاط الجامعة إلى مرحلة جديدة تلائم ذوق العصر.