تحت إشراف هذا القسم تمارس لجنة الإفتاء المكونة من خمسة أعضاء من أساتذة الجامعة نشاطها منذ تأسيس الجامعة، فتجيب على الأسئلة الواردة إليها من المسلمين في الهند، وترشدهم إلى ما هو الصواب في المسائل التي اختلفت فيها أنظار العلماء، وتبصرهم بمزايا الشريعة الإسلامية وما فيها من السمو والكمال والصلاح لكل مصر وعصر.
ولتقدير نشاط هذه اللجنة نقول: إن الإجابات التي صدرت إلى الآن من لجنة الإفتاء قد بلغت (31) مجلدا بالقطع الكبير. الجامعة عازمة على طبعها.